Ingénieur / ingénieure d'études en Bio-informatique

Référence : 2026-2418378

  • Fonction publique : Fonction publique de l'État
  • Employeur : Ecole Pratique des Hautes Etudes (EPHE)
  • Localisation : Muséum National d'Histoire Naturelle, 16 rue Buffon, 75005, Paris
Domaine : Recherche
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  • Nature de l’emploi Emploi ouvert aux titulaires et aux contractuels
  • Expérience souhaitée Non renseigné
  • Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels Non renseignée Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
  • Catégorie Catégorie A (cadre)
  • Management Non renseigné
  • Télétravail possible Non renseigné

Vos missions en quelques mots

ACTIVITÉS PRINCIPALES

La candidate ou le candidat retenu sera responsable de la gestion et du traitement bio-informatique des données, notamment du type « Next Generation Sequencing » (NGS), issues de plusieurs projets de l’équipe et ponctuellement venir en appui aux projets des autres équipes de l'UMR. Elle ou il devra utiliser et développer des pipelines bio-informatiques pour le traitement des librairies produites par des méthodes de type Whole Genome Sequencing (Illumina sort-reads), long read sequencing (PacBio et ONT), Hi-C sequencing, ou transcriptomique (long et short reads). Outre le traitement bio-informatique, elle ou il devra également analyser les données produites et présenter et interpréter les résultats dans leur contexte scientifique. Ces investissements se traduiront notamment par la co-signature des articles scientifiques de l’équipe. En termes de gestion des données, la personne recrutée devra coordonner la sauvegarde des données « omics » sur les serveurs de l’EPHE-PSL en accord avec la direction des systèmes d’information de l’EPHE-PSL.

Profil recherché

COMPÉTENCES REQUISES

Savoirs

- Maîtrise de l’analyses de données « omics »,

- Connaissances au moins superficielles des différences techniques de séquençage NGS, et surtout des données produites par ces méthodes,

- Connaissance du système d’exploitation GNU/Linux ou autre Unix-like,

- Connaissance d’au moins un langage de programmation utilisé en analyse de données (R, Python, Perl, Julia, …).

- Connaissance de la syntaxe d’un shell en ligne de commande (notamment bash, zsh ou fish, et les programmes GNU comme sed ou awk)

Localisation

Localisation : Muséum National d'Histoire Naturelle, 16 rue Buffon, 75005, Paris

Éléments de candidature

Documents à transmettre

Pour postuler à cette offre, l'envoi du CV et d'une lettre de motivation est obligatoire

Qui sommes-nous ?

L’École Pratique des Hautes Études (EPHE) est un grand établissement d’enseignement supérieur et de recherche, établissement-composante de l’Université Paris Sciences et Lettres (PSL), et membre fondateur du Campus Condorcet. L’EPHE-PSL est implantée sur plusieurs sites en France métropolitaine et en Polynésie française.

La candidate ou le candidat retenu travaillera au sein de l'équipe DIVA (« Diversification et adaptation aux échelles micro et macro-évolutives ») de l’Institut de Systématique, Évolution, Biodiversité (ISYEB, UMR 7205) située au Muséum National d’Histoire Naturelle à Paris. L’équipe DIVA est composée de 11 enseignants-chercheurs permanents, deux techniciennes, un ingénieur de recherche, et plusieurs doctorants / doctorantes et stagiaires. L’équipe mène des recherches portant sur les processus évolutifs à travers diverses disciplines comme la génétique des populations, l’écologie comportementale, la génétique quantitative, l’écologie évolutive, en partenariat avec plusieurs équipes en France et à l’étranger.

À propos de l'offre

  • Susceptible d'être vacant à partir du 01/01/2027

  • Experte / Expert en production, traitement et analyse de données

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    publique
    Territoriale

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