Ingénieur d'études H/F - Étude du mode d’action des rhamnolipides pour la protection des plantes - Inte

Missions :
Dans le contexte actuel d’objectif de réduction des intrants utilisés dans les cultures, il est capital de développer des moyens de protection respectueux de l’environnement et de la santé humaine. Les rhamnolipides, molécules naturelles sécrétées par des bactéries, ont la double propriété de stimuler les réactions de défense des plantes et d’avoir des propriétés antifongiques directes. Ces composés sont donc très intéressants pour des applications en biocontrôle afin de réduire l’usage des pesticides de synthèse. Ces molécules sont connues pour avoir une affinité avec la fraction lipidique de la membrane plasmique à la fois des plantes, pour exercer leur action de stimulateur de défense, et sur champignon, pour déclencher une action biocide. Comprendre les déterminants membranaires spécifiques impliqués dans ces mécanismes d’action est essentiel pour favoriser, à terme, leur utilisation en conditions de culture.
Activités :
L’ingénieur aura pour mission de cultiver du mycélium du champignon phytopathogène Botrytis cinerea en conditions in vitro et en enceinte climatique, afin de permettre l’analyse de la composition lipidique de sa membrane plasmique par un partenaire du projet. Certains lipides ayant été identifiés comme impliqués dans le mode d’action antifongique des rhamnolipides, il s’agira également de réaliser une mutagenèse de leur voie de biosynthèse par une approche CrispR/cas9 chez ce même pathogène. Selon l’avancement du projet, des extractions et analyses de lipides seront réalisées sur ces mutants et une étude de leur perméabilisation par les rhamnolipides sera menée en microscopie confocale. Des tests antifongiques seront également réalisés, notamment pour évaluer l’efficacité de rhamnolipides de différentes structures.
Les compositions lipidiques permettront également d’obtenir des liposomes mimant la membrane plasmique végétale ou fongique, ou des monocouches de lipides mimant le feuillet externe, afin de réaliser des expériences de biophysique et étudier spécifiquement les paramètres influençant l’interaction des rhamnolipides avec les lipides membranaires. Ces tests consisteront, entre autres, à caractériser les propriétés membranaires et de structure des liposomes à l’aide de sondes fluorescentes et de diffusion dynamique de lumière (DLS).
L’ingénieur participera aux réunions au sein du laboratoire d’accueil et avec les partenaires du projet afin de présenter ses résultats.

Contexte de travail :
L’ingénieur d’études sera recruté au sein du laboratoire Génie Enzymatique et Cellulaire, UMR CNRS 7025. Il effectuera ses missions à l’Université de Technologie de Compiègne et également pour partie au sein de l’université de Picardie Jules Verne pour les expériences de biophysique. Le laboratoire est reconnu internationalement pour ses recherches centrées sur les bioressources, le biomimétisme et la bioinspiration. En particulier le thème de recherche « métabolisme
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