Ingénieur-e biologiste des plantes

Votre mission s'inscrira dans un contexte de renforcement des capacités de l'unité pour étudier les interactions entre les plantes et les champignons pathogènes. Les projets menés visent à développer des approches innovantes de phénotypage, d'imagerie, d'analyse d'image et d'édition du génome afin de mieux comprendre les mécanismes biologiques impliqués dans les maladies des plantes et leur résistance.

Ce poste contribue directement à l'amélioration des connaissances sur la santé des plantes et à la mise au point de méthodes expérimentales de nouvelle génération. Vos travaux participeront au développement d'outils à haut débit pour caractériser les interactions plantes-pathogènes. Vous assurerez la caractérisation des lignées transgéniques de plantes tant au niveau génétique, que moléculaire et phénotypique.

Dans ce cadre, vous serez en charge des activités suivantes :

Phénotypage et expérimentation sur les interactions plantes-pathogènes

- Optimiser les processus de production des plantes depuis la production des plantes et des inocula fongiques.

- Concevoir, réaliser et superviser des expérimentations d'inoculation de plantes par des champignons pathogènes.

- Évaluer la résistance ou la sensibilité de lignées végétales et caractériser l'agressivité de souches fongiques.

- Développer et optimiser des méthodes innovantes d'observation et de mesure des interactions biologiques (approches d'imagerie visible, hyperspectrale ou par fluorescence) pour l'analyse des symptômes et du statut physiologique des plantes.

- Contribuer au déploiement d'outils d'analyse d'image fondés sur l'intelligence artificielle, avec l'appui de bioinformaticiens de PHIM et de collaborateurs externes (plateforme INRAE PHENOTIC, Angers).

Transformation génétique et édition du génome

- Réaliser et superviser des expériences de transformation génétique et d'édition du génome chez les plantes.

- Produire des lignées transgéniques ou à génome édité.

- Assurer la caractérisation génétique, moléculaire et phénotypique des lignées obtenues.

- Participer à l'amélioration des protocoles de culture in vitro, de microbiologie et de biologie moléculaire.

Gestion des données et diffusion des savoir-faire

- Formaliser et documenter les protocoles expérimentaux selon les principes FAIR.

- Assurer la sauvegarde, l'organisation et l'accessibilité des données produites.

- Former et accompagner les personnels scientifiques, techniques et les étudiants aux méthodes développées.

- Participer aux collaborations internes et externes de l'unité.