Ingénieur-e en développement d'outils pour l'évaluation génomique
Référence : INRAE-CAMOB26-IR-GA-2
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement (INRAE)
- Localisation : Yvelines
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert aux titulaires et aux contractuels
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels Non renseignée Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Vous rejoindrez l'unité mixte de recherche INRAE/AgroParisTech Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI), dont les recherches visent à comprendre et exploiter la variabilité génétique des animaux pour analyser la construction des phénotypes d'intérêt en élevage, les interactions avec les écosystèmes microbiens et l'environnement au sens large, dans un contexte de transition agroécologique. L'unité compte 115 permanents. Vous intégrerez une équipe pluridisciplinaire, spécialisée en génétique et génomique bovine (GBOS), regroupant des chercheurs et personnels techniques, travaillant sur des données à grande échelle issues de dispositifs expérimentaux et de terrain. L'unité est rattachée à l'Université Paris-Saclay et est membre de l'Institut Sciences Animales Paris-Saclay. Elle s'appuie sur un réseau de partenariat développé, avec les organismes professionnels de l'élevage, des centres de ressources, des plates-formes technologiques et des unités expérimentales.
Vous identifierez et vous vous approprierez les outils et logiciels existants et développerez les outils manquants permettant d'intégrer de nouvelles données dans l'analyse du déterminisme génétique des caractères et l'évaluation génomique, à des fins de recherche mais aussi d'évaluation génétique. Le poste s'inscrit dans un contexte d'augmentation rapide des données biologiques disponibles (génomes, microbiote, épigénétique, environnement), nécessitant le développement d'outils adaptés pour leur intégration dans les analyses génétiques. L'objectif est d'améliorer les méthodes d'évaluation génomique et de mieux prendre en compte les interactions génotype x milieu, intégrer l'information de l'annotation des variants, du microbiote et des méthylations. Ce poste présente un fort enjeu scientifique et appliqué : contribuer à rendre les méthodes de prédiction génétique plus précises et robustes, afin de soutenir l'amélioration durable des animaux d'élevage. Vous participerez ainsi à des travaux ayant un impact direct sur les pratiques d'élevage et les performances des filières.
Dans ce cadre, vous serez en charge des activités suivantes :
Développement méthodologique et informatique
- Identifier et prendre en main les outils et logiciels existants
- Développer de nouveaux outils pour intégrer des données complexes (annotation des variants, microbiote, épigénétique, environnement)
- Mettre en œuvre des solutions adaptées à des volumes de données importants
Analyse de données et modélisation
- Exploiter des jeux de données variés (phénotypes, génotypes, pedigrees, données environnementales)
- Implémenter des évaluations génomiques intégrant différentes sources d'information
- Évaluer les performances des modèles en termes de précision des prédictions
Travail collaboratif et valorisation scientifique
- Collaborer avec les membres de l'équipe et les partenaires scientifiques et techniques
- Contribuer aux réflexions méthodologiques et aux projets de recherche de l'équipe
Profil recherché
Vous avez une formation supérieure avec de solides compétences en génétique quantitative, génétique statistique, biostatistique ou bioinformatique.
Une première expérience en développement d'outils ou en analyse de données génétiques à grande échelle est souhaitée.
Savoir-faire :
- Maîtriser les méthodes de génétique quantitative et/ou statistique
- Développer des outils informatiques (langages tels que C, Fortran, R, SAS…)
- Mettre en œuvre des analyses d'association et des évaluations génomiques
- Gérer et analyser des bases de données complexes
Le poste nécessite la pratique de l'anglais à un niveau B2.
Savoir-être :
- Capacité à travailler en équipe et en interaction avec des partenaires
- Rigueur et sens de l'organisation
- Esprit d'analyse et de synthèse
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 7 Master/diplômes équivalents
Qui sommes-nous ?
NOTRE AMBITION : AGIR POUR LA VIE, L’HUMAIN, LA TERRE
Premier organisme de recherche spécialisé au monde en agriculture, alimentation et environnement, INRAE est né le 1er janvier 2020 de de la fusion entre l’INRA et IRSTEA. Nous sommes une communauté de travail de 12 000 personnes, avec plus de 200 unités de recherche et une quarantaine d’unités expérimentales implantées dans 18 centres sur toute la France.
Notre Mission ?
Face à l’augmentation de la population, au changement climatique, à la raréfaction des ressources et au déclin de la biodiversité, INRAE construit des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources.
Pour répondre à ces grands enjeux mondiaux, nous avons besoin de renfort dans nos équipes. Des métiers de la recherche aux métiers de l’appui, l’INRAE recrute à tout niveau de diplôme (du CAP/BEP à Bac+8) !
Rejoignez une communauté engagée et agissez pour l’intérêt général !
À propos de l'offre
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Vacant à partir du 01/02/2027
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Experte / Expert en biologie - SVT
