Ingénieur-e en microbiologie et biologie moléculaire

Vous exercerez votre activité au sein de l’unité mixte de recherche STLO, Science et Technologie du Lait et de l’œuf, de l’INRAE rattachée au centre Bretagne Normandie et localisée à Rennes. Ce recrutement s’inscrit dans le cadre d’un projet de recherche financé par l’ANR, dont l’objectif est de mieux comprendre les risques microbiologiques liés aux bactéries présentes dans les aliments d’origine végétale, dans un contexte de transition vers une alimentation davantage végétalisée. Plus spécifiquement, ce projet vise à évaluer les risques de toxi-infections alimentaires staphylococciques associés à la consommation de produits d’origine végétale.Votre mission consistera à participer à la caractérisation génomique et phénotypique de souches de Staphylococcus aureus, à l’étude de leur comportement dans différentes matrices végétales, ainsi qu’à l’analyse de l’expression et de la production de toxines staphylococciques, notamment SEH et SEK.Vous serez plus particulièrement en charge de :- La culture et la manipulation de souches de Staphylococcus aureus en laboratoire niveau 2- L’extraction d’ADN, d’ARN et la préparation d’échantillons pour le séquençage- L’analyse et l’annotation de génomes bactériens- La caractérisation phénotypique des souches, notamment à l’aide de tests Biolog- L’étude du comportement et de la croissance des souches dans différentes matrices végétales- La réalisation d’analyses de biologie moléculaire (PCR, qPCR, clonage)- L’étude de l’expression de gènes (PCRq, RNA-seq) dans différentes conditions et matrices végétales- La participation à l’analyse et à l’interprétation des résultats expérimentaux- La contribution à la rédaction de rapports scientifiques et de publications- La gestion et de l’organisation du laboratoire (stocks, protocoles, traçabilité)