Ingénieur-e en traitement et analyse d'images biologiques
Référence : INRAE-CAMOB26-IE-PHASE-1
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement (INRAE)
- Localisation : Ille-et-Vilaine
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert aux titulaires et aux contractuels
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels Non renseignée Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Vous rejoindrez le Laboratoire de Physiologie et Génomique des Poissons, une unité de recherche qui étudie les grandes fonctions physiologiques des poissons, notamment la croissance, la reproduction et le comportement, afin de contribuer au développement durable des filières piscicoles. L'unité regroupe environ 70 personnes et s'appuie sur plusieurs plateformes et services techniques spécialisés en bioinformatique, histologie et imagerie.
Vous intégrerez le plateau technique d'histologie et d'imagerie, composé d'une assistante ingénieure responsable de plateau et d'un ingénieur de recherche référent scientifique. Vous travaillerez également en interaction étroite avec le plateau d'imagerie 3D et les équipes de recherche utilisatrices des outils d'imagerie.
Ce poste s'inscrit dans le développement des activités d'analyse et de valorisation des données d'imagerie biologique produites au sein de l'unité. Vous contribuerez à la mise en œuvre de méthodes de traitement d'images adaptées aux besoins des projets scientifiques, notamment pour l'analyse quantitative d'objets biologiques et le développement d'outils de visualisation et de gestion des données.
Dans ce cadre, vous serez en charge des activités suivantes :
Traitement et analyse d'images biologiques
- Mettre en œuvre et développer des méthodes de traitement d'images 2D et 3D.
- Réaliser des segmentations d'images afin de quantifier des structures biologiques d'intérêt.
- Développer des approches de quantification, de classification et de visualisation des données d'imagerie.
- Utiliser des méthodes classiques et des approches basées sur l'intelligence artificielle pour l'analyse d'images.
- Répondre aux besoins spécifiques des équipes de recherche en matière d'analyse d'images biologiques.
Gestion des outils et des données
- Assurer la gestion des outils logiciels et matériels dédiés au traitement d'images.
- Participer à la structuration, au stockage et à l'archivage des données d'imagerie dans le respect des principes FAIR.
- Mettre en place des solutions de partage et de sauvegarde des fichiers images.
- Rédiger et maintenir la documentation technique associée aux outils et procédures.
Appui scientifique et missions transversales
- Accompagner et conseiller les utilisateurs des plateformes d'imagerie.
- Assurer une veille scientifique et technologique dans le domaine du traitement d'images.
- Participer aux activités du Centre Automatisé de Traitement de l'Information (CATI) SICPA.
- Contribuer aux missions transversales de l'unité en tant que personne ressource en informatique.
Profil recherché
Vous êtes issu-e d'une formation en traitement d'images, informatique appliquée à l'imagerie biologique.
Une expérience significative en traitement d'images de microscopie et une expérience en laboratoire de recherche seront appréciées.
Savoir-faire :
- Mettre en œuvre des méthodes mathématiques de traitement et d'analyse d'images.
- Développer des outils de segmentation, de classification et de visualisation d'images.
- Programmer dans différents environnements informatiques.
- Utiliser des bibliothèques logicielles d'analyse d'images.
- Exploiter des approches d'intelligence artificielle appliquées à l'imagerie.
- Gérer des bases de données et des flux de données d'imagerie.
- Rédiger une documentation technique et accompagner les utilisateurs.
- Assurer une veille scientifique et technologique.
Savoir-être :
- Rigueur et fiabilité dans le suivi des activités.
- Autonomie et capacité d'adaptation.
- Sens du relationnel et du service aux utilisateurs.
- Goût pour le travail en équipe et les collaborations interdisciplinaires.
- Intérêt pour les environnements technologiques et scientifiques innovants.
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 6 Licence/diplômes équivalents
Qui sommes-nous ?
NOTRE AMBITION : AGIR POUR LA VIE, L’HUMAIN, LA TERRE
Premier organisme de recherche spécialisé au monde en agriculture, alimentation et environnement, INRAE est né le 1er janvier 2020 de de la fusion entre l’INRA et IRSTEA. Nous sommes une communauté de travail de 12 000 personnes, avec plus de 200 unités de recherche et une quarantaine d’unités expérimentales implantées dans 18 centres sur toute la France.
Notre Mission ?
Face à l’augmentation de la population, au changement climatique, à la raréfaction des ressources et au déclin de la biodiversité, INRAE construit des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources.
Pour répondre à ces grands enjeux mondiaux, nous avons besoin de renfort dans nos équipes. Des métiers de la recherche aux métiers de l’appui, l’INRAE recrute à tout niveau de diplôme (du CAP/BEP à Bac+8) !
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À propos de l'offre
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Vacant à partir du 01/02/2027
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Experte / Expert en calcul scientifique
