Ingénieur en bioinformatique spécialité génétique des populations H/F

Référence : 2024-1542714

  • Fonction publique : Fonction publique de l'État
  • Employeur : Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement (INRAE)
    L'Institut national de recherche pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (INRAE) est un établissement public de recherche.
  • Localisation : 63 000 Clermont-Ferrand
Domaine: Recherche
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Date limite de candidature : 15/05/2024

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  • Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
  • Nature du contrat

    CDD d'1 an
  • Expérience souhaitée Non renseigné
  • Rémunération (fourchette indicative pour les contractuels) . € brut/an
  • Catégorie Catégorie A+ (Encadrement supérieur - Autres emplois fonctionnels)
  • Management Non
  • Télétravail possible Non renseigné

Vos missions en quelques mots

Vous serez plus particulièrement en charge de :
Vous participerez à un projet ANR visant à étudier l’ADN ancien extraits de restes archéobotaniques de plantes (notamment de blé) ainsi que dans des sédiments. La mission confiée consiste à (1) analyser les séquences d’ADN ancien de plantes (Pont et al. 2019 doi: 10.1186/s13059-019-1627-1), (2) comparer la diversité génétique des espèces modernes à l’échelle populationnelle (Pont et al. 2019 doi.org/10.1038/s41588-019-0393-z) pour l’identification exhaustive de variants génétiques (polymorphisme SNP), et en intégrant les deux analyses précédentes, (3) identifier les traces de domestication-sélection (analyses phylogénétiques-démographiques, descriptives, fréquences alléliques…). L’analyse de séquences issues de métagénomique et metabarcoding de sédiments sera aussi envisagée.

Profil recherché

  • Formation recommandée : ingénieur ou titulaire d’un Master dans le domaine de la génétique (et particulièrement génétique des populations)
  • Connaissances souhaitées : Maîtrise de langages de programmation (, perl, JAVA, SQL, R, …) ainsi que des outils d’interfaçage appliqués aux systèmes d'exploitation en génomique. Exploitation des séquences (comparaison/mapping de séquences, utilisation de banque de données biologiques, alignements multiples, phylogénie, génétique populationnelle…). Maîtrise des techniques d’analyse de metabarcoding, métagénomique, et statistiques associées.
  • Expérience appréciée : génomique et génétique des populations.
  • Aptitudes recherchées : rigueur, autonomie, motivation, communication en anglais

Niveau d'études minimum requis

  • Niveau Niveau 7 Master/diplômes équivalents
  • Spécialisation Sciences de la vie

Compétences attendues

Maîtrise de langages de programmation (C, perl, JAVA, SQL, R, …) ainsi que des outils d'interfaçage appliqués aux systèmes d'exploitation en génomique. Exploitation des séquences (comparaison/mapping de séquences, utilisation de banque de données biologiques, alignements multiples, phylogénie, génétique populationnelle…). Maîtrise des techniques d'analyse de metabarcoding, métagénomique, et statistiques associées.

Langues

  • Anglais Avancé ou indépendant

Éléments de candidature

Documents à transmettre

Pour postuler à cette offre, l'envoi du CV et d'une lettre de motivation est obligatoire

Personnes à contacter

  • Caroline Pont
  • Jérôme Salse

Qui sommes-nous ?

NOTRE AMBITION : AGIR POUR LA VIE, L’HUMAIN, LA TERRE

Premier organisme de recherche spécialisé au monde en agriculture, alimentation et environnement, INRAE est né le 1er janvier 2020 de de la fusion entre l’INRA et IRSTEA. Nous sommes une communauté de travail de 12 000 personnes, avec plus de 200 unités de recherche et une quarantaine d’unités expérimentales implantées dans 18 centres sur toute la France.

En savoir plus sur l'employeur

À propos de l'offre

  • Vous serez serez amené à travailler sur 2 sites distants de 5 kilomètres.

  • Susceptible d'être vacant à partir du 01/07/2024

  • *Experte / Expert en sciences humaines et sociales*

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