Ingénieur en imagerie live de la traduction (H/F)

Missions :
Le SARS-CoV-2 est un virus à ARN simple brin de polarité positive responsable de la pandémie de COVID-19. Au cours de son cycle infectieux, il produit un ARN génomique et plusieurs ARN sous-génomiques qui possèdent des régions non traduites en 5′ (5′UTR) distinctes. Ces régions, composées d’une séquence Leader commune et de séquences variables spécifiques à chaque ARN viral, jouent vraisemblablement un rôle majeur dans la régulation de l’initiation de la traduction et dans la modulation des niveaux de production des protéines virales. Malgré leur importance potentielle dans le cycle viral, la contribution précise des différentes 5′UTR à la dynamique de la traduction et à l’expression différentielle des protéines du SARS-CoV-2 demeure encore insuffisamment caractérisée.
Sous la responsabilité du responsable de projet, la personne recrutée contribuera à un projet de recherche visant à déterminer le rôle des différentes régions 5′UTR du SARS-CoV-2 dans la régulation spatio-temporelle de la traduction des ARN viraux. Elle aura en charge la conception et la réalisation d’approches expérimentales combinant biologie moléculaire, production d’ARNm synthétiques, culture de cellules pulmonaires humaines et développement de systèmes rapporteurs permettant l’étude de la traduction en cellules vivantes. Elle participera à la mise en œuvre et à l’optimisation de techniques d’imagerie de la traduction en temps réel, au suivi de la dynamique traductionnelle à l’échelle de l’ARNm individuel, ainsi qu’à l’acquisition, au traitement et à l’analyse quantitative des données d’imagerie. Elle contribuera également à l’étude de l’impact de variations nucléotidiques des 5′UTR sur l’initiation de la traduction et sur l’expression des protéines virales, afin d’identifier les déterminants moléculaires impliqués dans la régulation de la synthèse protéique du SARS-CoV-2.

Activités :
• Concevoir et produire des constructions rapporteuses et des ARNm synthétiques portant différentes régions 5′UTR du SARS-CoV-2.
• Mettre en œuvre des approches de biologie moléculaire (clonage, transcription in vitro, PCR, RT-qPCR, Western blot).
• Réaliser des expériences de culture et de transfection de cellules pulmonaires humaines.
• Développer et optimiser des approches d'imagerie de la traduction en cellules vivantes.
• Réaliser des acquisitions de microscopie de fluorescence et le suivi de la traduction en temps réel.
• Analyser et quantifier des données d'imagerie et de biologie moléculaire.
• Étudier l'impact de variations de séquence des régions 5′UTR sur l'initiation de la traduction et l'expression des protéines virales.
• Analyser, interpréter et présenter les résultats expérimentaux.
• Rédiger des rapports d'expériences et assurer la tenue du cahier de laboratoire.
• Participer aux réunions de laboratoire, à la veille scientifique et aux tâches collectives de l'équipe.

Contexte de travail :
Le travail sera réalisé à
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