Ingénieur.e en agro-écologie

Les interactions entre plantes jouent un rôle clé dans les écosystèmes naturels et agricoles. En agriculture, les cultures associées — culture simultanée de plusieurs espèces sur une même parcelle — notamment celles qui incluent des légumineuses améliorent la disponibilité en azote des cultures et limitent les intrants de synthèse en azote, tout en maintenant les rendements. Nos résultats précédents ont montré que la présence d’Arabidopsis thaliana (brassicacée) modifie la mise en place de la symbiose rhizobienne chez Medicago truncatula (légumineuse), avec un effet dépendant du génotype d’A. thaliana. Toutefois, les bases génétiques de cette interaction et les conséquences écophysiologiques associées restent inconnues. Le projet SYMBIPLANTS propose de répondre à ces questions (1) en étudiant l’impact des co-cultures brassicacées/légumineuses d’espèces modèles et cultivées sur la mise en place de la nodulation, (2) en explorant les bases génétiques de cet effet chez A. thaliana afin d’identifier les gènes et les voies de signalisation impliqués et (3) en caractérisant les processus écophysiologiques engagés dans ces interactions. Pour cela, nous mobiliserons des études d’association pangénomique (Genome-Wide Association Study - GWAS), du phénotypage automatisé et haut-débit des systèmes aériens et racinaires de co-cultures en Rhizotubes, et des analyses écophysiologiques pour mesurer l’impact de l’interaction sur la nutrition azotée notamment. SYMBIPLANTS permettra de mieux comprendre les interactions génétiques mobilisées dans les cultures associées, leurs conséquences écophysiologiques et, à terme, d’optimiser l’incorporation de l’azote en co-culture via la symbiose rhizobienne.