Ingénieur/e Génie Informatique et statistiques

Dans ce contexte vos missions seront:
1) assurer le maintien et l'évolution du SI PathoBase à PV:
-assurer le versioning, le débogage et la création de requêtes génériques et de rapports de synthèse
-analyser l'évolution des besoins des utilisateurs en fonction des modèles biologiques et des projets de recherche et réaliser les développements, les tests et le déploiement des solutions retenues
-assurer la formation des utilisateurs de PathoBase et promouvoir les bonnes pratiques autour de la production, la gestion et le partage des données en interaction avec les Référentes Données Opérationnelles (RDO) de l'Unité
-contribuer à automatiser la saisie des informations dans ce SI via l'utilisation de code-barres, GPS, formulaires d'enquêtes (KoBoToolbox), banques d'images
-participer à la mise en place des pipelines d'analyse (interrogation du SI, préparation des données, exécution de calculs scientifiques)
2) Coordonner progressivement le transfert de l'architecture de Pathobase vers d'autres Unités SPE partageant les mêmes contraintes de gestion, de traçabilité et de partage des données. Dans un premier temps, ce transfert s'effectuera vers 4 Unités (PSH, PHIM, DGIMI et CBGP) au sein desquelles des référent.e.s informatiques prendront en charge les aspects pratiques de l'installation et du maintien du SI dans les Unités. Vous travaillerez avec ces référent.es pour:
-évaluer la faisabilité du transfert du SI en fonction des besoins utilisateurs: nécessité d'adaptation de modules ou de développement de nouveaux modules, évolution de l'interfaçage, etc.
-proposer et implémenter des solutions à tester pour répondre aux besoins identifiés
-former les référent.e.s informatiques des unités aux nouvelles fonctionnalités
-identifier des possibilités concrètes de déploiement répondant aux nécessités de sauvegarde, de restauration et d'accès sécurisé aux données partagées.
Le travail sera réalisé en collaboration étroite avec l'ingénieur ayant développé PathoBase. Vous bénéficierez de l'appui de chercheur.e.s impliqué.e.s dans le développement de ce SI pour clarifier les besoins utilisateurs et prioriser les actions à mener. Vous vous appuierez sur le réseau de compétences en gestion de bases de données des plateformes GeOpen4S et Epidémiologiesurveillance en Santé Végétale à Avignon. Le transfert vers les autres Unités sera réalisé en interactions avec les référent.e.s informatiques et les RDO et sous l'égide de la Direction du Département SPE.