Post-doctorat (H/F) Analyse génomique du régime alimentaire du renard

Missions :
Description du projet :
L’évolution de la structure des paysages agricoles au cours des dernières décennies (remembrement, diminution des haies/bosquets, homogénéisation du paysage), en lien avec l’intensification de l’agriculture, est considérée comme la principale cause de déclin de la biodiversité dans ces milieux (Macdonald et al. 2007, BirdLife International 2018, Batary et al. 2020). Si l’impact au niveau spécifique a été plutôt bien documenté, il existe encore un manque de connaissance sur l’impact de l’évolution du paysage sur les relations interspécifiques, telles que la compétition ou la prédation, en particulier dans les milieux tempérés.
La prédation est une pression adaptative très importante pour les espèces et est considérée comme l’une des composantes structurantes du fonctionnement d’un écosystème, à la fois via les relations directes de prédation, mais aussi la compétition entre prédateurs pour les proies. Compte tenu des différents niveaux trophiques possibles, l’étude de la prédation peut rapidement devenir très vaste et complexe, car cela nécessite en effet de pouvoir estimer (i) la composition spécifique et l’abondance des espèces de proies, (ii) la composition et l’abondance des espèces de prédateurs, et enfin, (iii), la consommation des espèces de proies par ces prédateurs.
Le programme IPARI (Impact de l’évolution du Paysage Agricole sur les Relations Interspécifiques) vise à préciser comment le paysage modelé par les systèmes de production structurent les chaînes trophiques dans des agroécosystèmes intensifs soit en modulant les taux de prédation (effets comportementaux et équilibre proies principales/proies alternatives) soit en modulant les abondances des prédateurs (prédation partagée).
Dans le cadre de ce programme, nous souhaitons nous concentrer sur les relations trophiques impliquant mammifères et oiseaux prédateurs, au sein des agrosystèmes intensifs en France. En effet, les questions du rôle de la régulation de certaines espèces proies (e.g. le renard roux et son rôle potentiel d’auxiliaire de culture - car prédatant les campagnols en milieu herbager; son impact sur certaines espèces enjeux de conservation montrant des tendances évolutives négatives comme les perdrix grise et rouge en milieu agricole) par les prédateurs généralistes sont récurrentes et utilisées pour argumenter sur la gestion, et en particulier, sur les prélèvements effectués sur les petits et meso-carnivores, et le renard en premier lieu. Nous souhaitons donc étudier les relations impliquant les petits mammifères herbivores (micromammifères et lagomorphes) et leurs prédateurs, mammifères (mésocarnivores) et aviaires (rapaces et corvidés).

L’objectif de notre projet est d‘identifier les principales relations prédateurs-proies mammifères/oiseaux et de modéliser leur fonctionnement en fonction de la structure du paysage agricole (façonnée par les systèmes de production et les pratiqu
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