Postdoc - instrumentation optique H/F
Référence : UMR7647-TATCHO-003
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
- Localisation : 91128 PALAISEAU (France)
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
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Nature du contrat
CDD d'1 an
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels entre 3131,32€ et 4341,70€ bruts mensuels selon l'expérience € brut/an Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Missions :
Les principaux objectifs du travail du/de la chercheur(e) postdoctoral(e) sont les suivants :
1. La mise à niveau du microscope de Mueller en transmission existant, fonctionnant dans le visible et l’UV-A en mode de diffusion élastique (DE), vers une configuration à double géométrie (transmission + réflexion) et intégrant un mode de mesure en autofluorescence (AF) (plages d’excitation/émission : [315–400]/[400–700] nm) ;
2. La réalisation de mesures de matrices de Mueller (MM) — en modes DE et AF, en géométries de réflexion et de transmission — sur des coupes fines de biopsies cutanées annotées par le partenaire médical ;
3. Le post-traitement des données polarimétriques afin de générer des cartes diagnostiques de dépolarisation, de diatténuation, de retardance et d’orientation de l’axe optique, par application d’algorithmes de décomposition des matrices de Mueller.
Activités :
Le travail du/de la chercheur(e) postdoctoral(e) comprendra :
- la conception et la réalisation du bras de réflexion du microscope de Mueller en transmission ;
- l’étalonnage de l’instrument en modes de réflexion DE (diffusion élastique) et AF (autofluorescence) ;
- la modification de l’interface MATLAB du microscope de Mueller en transmission afin de permettre des mesures en modes DE et AF en géométrie de réflexion ;
- la validation de l’instrument par l’acquisition de données sur des systèmes tests simples et le traitement des images polarimétriques obtenues ;
- la réalisation de mesures de matrices de Mueller sur des coupes fines de biopsies cutanées fournies par le partenaire médical et la génération de cartes polarimétriques ;
- la constitution d’une base de données d’images expérimentales de matrices de Mueller de coupes fines de peau, ainsi que des cartes polarimétriques associées.
Contexte de travail :
Le projet Opticskin est mené par un consortium réunissant l’Université de Lorraine, Nancy, l’Université Claude Bernard Lyon 1, l’École polytechnique, Palaiseau, et le Centre hospitalier régional de Metz, et s’appuie sur des compétences complémentaires en : (i) expertise clinique et biologique, (ii) traitement, analyse et modélisation de données multidimensionnelles, et (iii) caractérisation optique de matériaux biologiques par spectroscopie de réflectance diffuse, spectroscopie d’autofluorescence, spectroscopie Raman, imagerie de durée de vie de fluorescence (FLIM) et imagerie polarimétrique de Mueller.
L’objectif principal du projet Opticskin est de réaliser une avancée majeure dans la compréhension des propriétés optiques et des signatures spectroscopiques de la peau humaine saine, précancéreuse et cancéreuse, grâce à une approche interdisciplinaire, multimodale et multi-échelle, combinant expérimentation et modélisation.
Les objectifs du projet incluent notamment :
– la construction d’une base de données cohérente, unique et innovante des caractéristiques histologiques et spectroscopiques opti
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Profil recherché
Competences :
- Le/la candidat(e) doit être titulaire d’un doctorat en imagerie optique, instrumentation scientifique, physique appliquée, imagerie biomédicale ou dans un domaine étroitement connexe.
- Le/la candidat(e) devra démontrer une solide expertise en développement instrumental avancé, incluant la conception, la caractérisation et l’intégration de systèmes optiques complexes, ainsi que le traitement du signal et de l’image ; une expérience en polarimétrie de Mueller constituera un atout.
- Une maîtrise de la modélisation numérique, associée à de solides compétences en programmation (Python, MATLAB, CUDA ou équivalent), est requise. Une capacité démontrée à aborder des problématiques multi-échelles et à contribuer au développement de prototypes innovants en imagerie sera particulièrement appréciée.
- Une bonne connaissance de la métrologie optique, de l’étalonnage des chaînes d’acquisition et de la conception de dispositifs expérimentaux de haute précision sera fortement valorisée. Une expérience dans la validation ou l’automatisation d’instruments dédiés à l’étude de milieux complexes sera également appréciée.
- Le/la candidat(e) retenu(e) évoluera dans un environnement scientifique interdisciplinaire exigeant et contribuera à des objectifs de recherche ambitieux, nécessitant autonomie, rigueur, créativité et capacité à produire des résultats scientifiques de haute qualité.
Contraintes et risques :
L’utilisation de la source UV-A du microscope de Mueller requiert le port de lunettes de protection ainsi qu’une formation adéquate aux règles de sécurité.
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents
- Spécialisation Formations générales
Langues
- Français Seuil
Qui sommes-nous ?
Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.
C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.
Depuis plus de 80 ans, le CNRS développe des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait du CNRS un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde.
Le partenariat qui lie le CNRS avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
À propos de l'offre
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Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
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Vacant
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Chercheuse / Chercheur