Postdoc H/F - Reconstruction pseudo-saine d'images TEP FDG cérébrales pour la détection automatique d'a
Référence : UMR7225-NINBUR-009
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
- Localisation : 75013 PARIS 13 (France)
Partager la page
Veuillez pour partager sur Facebook, Twitter et LinkedIn.
- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
-
Nature du contrat
CDD d'1 an
- Expérience souhaitée Non renseigné
-
Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels Entre 3300€ et 4200€ bruts mensuels selon expérience € brut/an Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Missions :
Le/la postdoctorant(e) aura pour mission d'appliquer, de valider et d'évaluer un ensemble de méthodes complémentaires de détection d'anomalies sur des images TEP FDG cérébrales, avec un focus particulier sur la détection de zones d'hypométabolisme liées à l'épilepsie dans le contexte de l'épilepsie pharmaco-résistante.
Activités :
Contexte scientifique et activités
L'imagerie TEP dans l'épilepsie pharmaco-résistante
La TEP au 18F-fluorodésoxyglucose (FDG) est devenue une modalité clé dans le bilan pré-chirurgical de l'épilepsie pharmaco-résistante, car elle permet de révéler des zones d'hypométabolisme cérébral associées aux zones épileptogènes. En pratique clinique, cependant, les images TEP sont analysées visuellement, et la sensibilité ainsi que la spécificité de cette approche dépendent fortement de l'expérience de l'observateur. Les anomalies chez les patients épileptiques sont souvent subtiles et spatialement diffuses, ce qui les rend particulièrement difficiles à identifier de manière fiable. Il existe donc un besoin clinique fort pour des outils automatisés et fondés sur les données, capables de localiser objectivement ces anomalies et d'aider à la planification chirurgicale.
Reconstruction pseudo-saine pour la détection d'anomalies
Notre équipe a développé une famille de méthodes de détection d'anomalies reposant sur la construction d'une image pseudo-saine spécifique au sujet : lors de l'inférence, l'image du patient est comparée à sa reconstruction pseudo-saine, produisant une carte d'anomalies mettant en évidence les zones qui s'écartent de ce qui serait attendu en l'absence de pathologie. Dans le contexte de l'épilepsie pharmaco-résistante, de telles cartes pourraient aider les cliniciens à mieux localiser les zones épileptogènes et, in fine, améliorer la prise en charge des patients.
Approches par recalage et fusion. Les approches voxelwise traditionnelles recalent l'image TEP du sujet dans un espace standard et la comparent à une population de sujets contrôles à l'aide de z-scores. Leur sensibilité est toutefois limitée par la variabilité interindividuelle de la fixation du traceur dans les régions non pathologiques. Pour y remédier, des approches spécifiques au sujet ont été proposées, consistant à recaler plusieurs sujets contrôles sains vers le sujet cible et à les combiner par fusion d'images afin de créer un modèle d'apparence saine [1]. Bien que ces méthodes soient devenues moins courantes en raison de préoccupations liées à leur vitesse et leur précision, les récentes avancées en matière de recalage basé sur l'apprentissage profond ont amélioré ces deux aspects, rendant pertinente leur réévaluation. Des travaux récents au sein de notre équipe ont démontré le potentiel de cette stratégie de recalage modernisée pour la synthèse d'images FDG TEP pseudo-saines [2].
Approches par modèles génératifs profonds. Les approches plus récentes de détection d'anomalies uti
Voir plus sur le site emploi.cnrs.fr...
Profil recherché
Competences :
- Doctorat en analyse d'images médicales, informatique, mathématiques appliquées ou domaine connexe
Expertise en détection d'anomalies par modèles génératifs profonds (VAE notamment) et/ou recalage d'images
- Programmation Python et PyTorch
- Expérience en neuro-imagerie cérébrale 3D, en particulier TEP FDG
- Bonnes capacités de communication et de travail en équipe interdisciplinaire
- Maîtrise de l'anglais requise
Contraintes et risques :
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents
- Spécialisation Formations générales
Langues
- Français Seuil
Qui sommes-nous ?
Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.
C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.
Depuis plus de 80 ans, le CNRS développe des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait du CNRS un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde.
Le partenariat qui lie le CNRS avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
À propos de l'offre
-
Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
-
Vacant
-
Chercheuse / Chercheur