Technicien.ne en biologie : étude du microbiote de la vigne et de la résistance de la vigne au Botryti

Contexte scientifique de travail La création de nouvelles variétés mieux adaptées au changement climatique, mais également plus respectueuses de l’environnement est une priorité pour la filière viticole.Depuis plusieurs années, les concepts d’holobionte et de microbiote se sont développées chez les plantes. Il s’agit de l’ensemble des micro-organismes en interaction avec les plantes et qui peuvent avoir des effets positifs notamment la protection des plantes vis-à-vis d’agents pathogènes, rendant la plante moins sensible, et donc moins dépendante des produits phytosanitaires. Des travaux de recherches ont débuté dans l’équipe DAAV de l’UMR AGAP en 2017 avec une première étude du microbiome de la vigne visant à identifier les principaux facteurs influençant le microbiote foliaire (phyllosphère) et de la baie de raisin (carposphère)1. Si le facteur le plus important façonnant le microbiote est l’environnement, le génotype de la plante a lui aussi un effet dans un environnement donné. Nous souhaitons aller plus loin pour identifier des traits morphologiques, anatomiques, phénologiques ou physiologiques de la vigne au niveau de la feuille qui favorisent le recrutement de micro-organismes, notamment des micro-organismes protecteurs contre le mildiou, maladie importante de la vigne causant des dommages très important.Ce travail est réalisé dans le cadre du programme de recherche PARSADA « Get-Up », qui a pour objectif de développer des stratégies de biocontrôle du mildiou, basées sur la gestion du microbiote de la vigne2.Par ailleurs, l’équipe DAAV est également impliquée dans le projet Européen GrapeBreed4IPM3 et plus particulièrement dans la tâche de caractérisation des bases génétiques de la résistance à la pourriture grise chez la vigne. La pourriture grise est causée par le champignon Botrytis cinerea qui cause des dégâts notamment sur les baies. Un élément important de la sensibilité au botrytis est l’épaisseur de la pellicule de la baie de raisin et sa perméabilité. La perméabilité de la pellicule des baies, barrière cruciale contre le Botrytis, mesurée à l'aide de capteurs d'impédance, peut être utilisée comme indicateur de la résistance à l'infection par Botrytis cinerea41 Voir Singh et al, 2018. doi:10.3390/microorganisms6040096, Singh et al, 2018. https://doi.org/10.1080/21553769.2018.15526282 https://getup.inrae.fr/actions-de-recherche;3 https://grapebreed4ipm.com/4 Herzog et al. (2022): https://doi.org/10.3389/fpls.2021.808365MISSIONS ET ACTIVITES