Thèse (H/F)

Sujet de thèse :
La maladie rénale chronique (MRC) touche environ 10 % de la population mondiale et induit un remodelage vasculaire majeur, avec rigidité artérielle, hypertrophie ventriculaire gauche et calcifications vasculaires (CV). Les CV constituent une complication cardiovasculaire majeure de la MRC, associée à une surmortalité pouvant atteindre un facteur 1000 par rapport à la population générale du même âge. Malgré les traitements actuels ciblant les troubles minéraux et osseux (CKD-MBD), la progression des CV n'est pas efficacement prévenue, y compris après transplantation rénale.
Alors que les CV associées à la MRC sont largement étudiées chez l'adulte, les mécanismes sous-jacents restent mal connus chez l'enfant. La MRC pédiatrique constitue pourtant un modèle unique pour étudier les CV : les causes de la maladie sont le plus souvent des anomalies congénitales limitées au rein et aux voies urinaires (CAKUT), sans les comorbidités systémiques (diabète, tabac, vieillissement) qui compliquent l'interprétation chez l'adulte. Les données préliminaires de l'équipe (analyses multi-omiques d'artérioles pédiatriques) ont permis d'identifier un réseau moléculaire dysrégulé impliquant la matrice extracellulaire et la signalisation immunitaire, reliant remodelage matriciel et voie Wnt/β-caténine.
Le projet VASC-OPATH propose une stratégie translationnelle combinant l'analyse de prélèvements pédiatriques et la validation fonctionnelle des mécanismes moléculaires identifiés dans un modèle in vitro innovant. Le/la doctorant(e) recruté(e) contribuera aux trois axes de recherche du projet :
• Analyse en séquençage d'ARN en cellule unique (snRNAseq) d'artérioles microdisséquées provenant d'enfants avec fonction rénale normale et d'enfants atteints de MRC de stade 5 (avant dialyse), afin d'établir la cartographie cellulaire et moléculaire de la vasculopathie pédiatrique précoce (cellules endothéliales, cellules musculaires lisses, fibroblastes, cellules immunitaires dont les macrophages).
• Modélisation de l'atteinte vasculaire de type MRC dans des organoïdes vasculaires 3D dérivés de cellules souches pluripotentes induites (iPSC), exposés au phosphate, à des toxines urémiques et à des cytokines pro-inflammatoires, afin de caractériser le remodelage vasculaire, de la matrice extracellulaire et de la signalisation Wnt/β-caténine.
• Validation fonctionnelle par invalidation génique CRISPR/Cas9 (lignées iPSC isogéniques knock-out pour les gènes ciblés sur le modèle d'organoïde vasculaire, afin d'établir un lien causal entre ces gènes cibles et le phénotype de calcification vasculaire.
Ce travail de thèse, à l'interface entre biologie vasculaire, immunologie, biologie des cellules souches et néphrologie translationnelle, vise à mieux comprendre les mécanismes cellulaires et moléculaires précoces des CV afin d'identifier de nouveaux biomarqueurs diagnostiques et cibles thérapeutiques potentielles chez l'enfan
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