Université Lyon 1 - Chargé de projets (H/F)

Référence : 2026-2290366

  • Fonction publique : Fonction publique de l'État
  • Employeur : Université Claude Bernard Lyon 1
    Université Claude Bernard Lyon 1
  • Localisation : Villeurbanne
Domaine : Recherche
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  • Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
  • Nature du contrat

    CDD de 6 mois
  • Expérience souhaitée Non renseigné
  • Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels 2534,14€ (brut/mois) € brut/an Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
  • Catégorie Catégorie A (cadre)
  • Management Non renseigné
  • Télétravail possible Non renseigné

Vos missions en quelques mots

La mission principale de l'ingénieur d'étude en bioinformatique sera le développement de pipeline de métagénomique virale (assignation taxonomique, assemblage, prédiction des hôtes potentiels ... ) et la mise a disposition de bases de données de référence de génomique virale utilisées. La personne recrutée développera plus particulièrement des chaines de traitement bioinformatique reproductibles (snakemake ou nextflow) qui auront vocation a être déployé sur le cloud académique de l'IFB et plus particulièrement dans un environnement sécurisé pour permettre le traitement des données associées au projets du PEPR SAMS. La mission secondaire concernera la formation des utilisateurs à l'utilisation des pipelines mises à disposition.

Profil recherché

Expérience professionnelle souhaitée dans le domaine : entre 1 et 3 ans

Compétences attendues :

  • Maîtrise des environnements Linux et des langages système (shell/bash).
  • Maîtrise des outils de gestion de versions des codes source (git, gitlab).
  • Maitrise des techniques Cloud et virtualisation (OpenStack, Docker, Kubernetes).
  • Maitrise souhaitable des outils de gestion de pipelines en Bio-informatique (Nextflow, Snakemake).
  • Maitrise souhaitable des outils d'analyse statistiques multivariées sous R ou python.
  • Compétence (appréciable) dan l'utilisation des outils de machine learning sous R ou python.
  • Compréhension de l'anglais oral et écrit.

Niveau d'études minimum requis

  • Niveau Niveau 6 Licence/diplômes équivalents

Éléments de candidature

Documents à transmettre

Pour postuler à cette offre, l'envoi du CV et d'une lettre de motivation est obligatoire

Qui sommes-nous ?

L’Université Claude Bernard Lyon 1 est une université pluridisciplinaire (santé, sciences, ESPE, Polytech, IUT, ISFA…). Composée de 16 composantes et 47 unités mixtes de recherche (UMR), 15 unités de recherche (UR), 17 structures fédératives dont 5 unités d’appui à la recherche (UAR).  Elle déploie son activité sur 13 sites. Elle compte près de 46 700 étudiants/étudiantes et emploie 4 921 personnels titulaires et contractuels.

Le budget de l’université s’élève à 516 millions d’euros dont 362 millions au titre de la masse salariale. Elle dispose en outre de deux filiales de droit privé.

À propos de l'offre

  • En tant qu’employeur responsable, l’Université Lyon 1 s’engage à favoriser la qualité de vie au travail, l’inclusion professionnelle et l’innovation individuelle et collective :

    • Ses engagements : Egalité, Diversité, Laïcité, Lutte contre toutes formes de discrimination et de harcèlement,

    • Ses conditions de travail : 37h30 de travail / 48,5 jours de congés, aménagement possible du temps de travail sur 4,5 jours, télétravail sous conditions,

    • Son accompagnement professionnel : Médecine de Prévention, Service social, Psychologue du travail, correspondant handicap, mission d’accompagnement professionnel des personnels, développement des compétences par le plan de formation,

    • Son action sociale, son offre culturelle : prestations sociales (crèche, centre de loisirs, restauration collective…), tarifs préférentiels loisirs, équipements sportifs, ateliers artistiques,

    • Son accessibilité : Localisation à proximité des grands axes routiers et des transports en commun, possibilité de stationnement, locaux sécurisés pour les vélos, forfait mobilité durable.

    Aucune candidature ne sera traitée dans l'outil. Il convient de se reporter aux contacts mentionnés dans la fiche de poste.

    Pour postuler : Dès que possible

    Envoyez un CV et lettre de motivation à : 

    job-ref-wiqv3lns4r@emploi.beetween.com

  • Vacant à partir du 01/06/2026

  • Experte / Expert en production, traitement et analyse de données

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