Chercheur-euse en diagnostic meta-génomique pour la Santé des Plantes

Référence : INRAE-OT-29358

  • Fonction publique : Fonction publique de l'État
  • Employeur : Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement (INRAE)
  • Localisation : Haute-Garonne
Domaine : Recherche
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  • Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
  • Nature du contrat Non renseigné
  • Expérience souhaitée Non renseigné
  • Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels Non renseignée Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
  • Catégorie Catégorie A (cadre)
  • Management Non renseigné
  • Télétravail possible Non renseigné

Vos missions en quelques mots

Environnement de travail : 

Vous intégrerez l’UMR 0441 LIPME (Laboratoire des Interactions Plantes-Microbes-Environnement), située sur le centre INRAE Occitanie-Toulouse. Vos travaux s'inscriront directement dans le cadre du projet D-P-SCH (Diagnostic de pathogènes par séquençage sans a priori au champ), soutenu par le département Santé des Plantes et Environnement (SPE) et par le projet FranceAgriMer CASDAR DISRUPP. Ce projet a pour objectif de développer un outil de diagnostic génétique générique et rapide en santé des plantes, reposant sur le séquençage shotgun sans a priori (technologie long reads Nanopore) couplé à une analyse bioinformatique innovante. Vous évoluerez au sein de la plateforme de bioinformatique et interagirez avec le service de séquençage de l'unité.

Profil recherché

Formation recommandée : Doctorat en écologie/épidémiologie moléculaire ou en génomique appliquée à la phytopathologie (champignons, bactéries, oomycètes).

Connaissances souhaitées : Connaissances en bioinformatique pour la génomique et/ou en biostatistiques. Maîtrise de R ou Python pour l’analyse et la visualisation de données. Capacité à travailler sous environnement Linux.

Aptitudes recherchées : Capacité à travailler en équipe, à acquérir rapidement de nouvelles connaissances sur plusieurs pathosystèmes, ainsi qu'à produire et soumettre des publications dans des revues scientifiques. Très bonne maîtrise de l’anglais, à l’oral comme à l’écrit.

Niveau d'études minimum requis

  • Niveau Niveau 6 Licence/diplômes équivalents

Qui sommes-nous ?

NOTRE AMBITION : AGIR POUR LA VIE, L’HUMAIN, LA TERRE

Premier organisme de recherche spécialisé au monde en agriculture, alimentation et environnement, INRAE est né le 1er janvier 2020 de de la fusion entre l’INRA et IRSTEA. Nous sommes une communauté de travail de 12 000 personnes, avec plus de 200 unités de recherche et une quarantaine d’unités expérimentales implantées dans 18 centres sur toute la France.

En savoir plus sur l'employeur

À propos de l'offre

  • Vacant à partir du 02/11/2026

  • Experte / Expert en biologie - SVT

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