Ingénieur biologiste en traitement de données - Equipe E.DUPREZ
Référence : 2026-2315446
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : INSERM - DR PACA - Corse
- Localisation : Marseille
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert aux titulaires et aux contractuels
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels Non renseignée Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
BAP | A |
Missions | L’équipe d’Estelle Duprez, Biologie moléculaire intégrative dans les leucémies (Inserm U1068, CNRS, Aix-Marseille Université et institut Paoli-Calmettes) recrute un(e) Ingénieur(e) d’Etudes en bioinformatique pour faire de l’analyse bioinformatique de données transcriptomiques et épigénétiques générées par le laboratoire L’équipe développe une approche de biologie des systèmes à partir de données OMICs (RNA-seq, ChIP-seq, ATAC-seq) générées en bulk ou à l’échelle de la cellule unique sur des modèles murins et/ou des cellules de patients leucémiques pour décrypter les mécanismes liés à la leucémie. La personne recrutée prendra en charge les analyses bioinformatiques des différents projets de l’équipe, elle sera amenée principalement à analyser des données de scRNA-seq avec un volet d’intégration multi-omics. L’objectif est d’étudier les corrélations entre les profils moléculaires et cellulaires en réponses à différents traitements afin de mieux comprendre les déterminants de la réponse/résistance thérapeutique. |
Activités principales | · Mettre en place et optimiser les procédures de recueil et de contrôle des données · Réaliser le traitement des données · Diffuser et valoriser des résultats sous forme de rapports techniques ou d'études · Adapter les applications informatiques aux besoins du projet |
Activités associées | · Encadrement et gestion de projet · Assurer une veille scientifique et technologique dans son domaine d'activité |
Profil recherché
Connaissances | · Avoir de bonnes connaissances de génomique et des notions de biologie du cancer · Connaissance des méthodes statistiques classiques et de leurs applications · Connaissance de l’environnement Linux/Unix |
Savoir-faire | · Maîtrise des outils biostatistiques et bioinformatiques, en particulier ceux utilisés pour les analyses de données NGS (RNAseq/single-cell RNAseq) · Maîtrise d’un langage de script (Python, Bash) · Excellente maitrise de R · Utilisation d’outils de versionning pour développement collaboratif (git) · Utilisation de logiciel de conteneurisation (type docker ou singularity) |
Aptitudes | · Travailler avec rigueur et méthode · Des capacités d’encadrement et de gestion de projet sont également souhaitables. · L'activité demande un bon niveau d'anglais (écrit et oral) pour échanger sur les ré... |
Qui sommes-nous ?
L’Inserm est le seul organisme public français entièrement dédié à la recherche biologique, médicale et en santé des populations. Il dispose de laboratoires de recherche sur l’ensemble du territoire, regroupés en 12 Délégations Régionales. Notre institut réunit 15 000 chercheurs, ingénieurs, techniciens et personnels administratifs, avec un objectif commun : améliorer la santé de tous par le progrès des connaissances sur le vivant et sur les maladies, l’innovation dans les traitements et la recherche en santé publique.
Rejoindre l’Inserm, c’est intégrer un institut engagé pour la parité et l’égalité professionnelle, la diversité et l’accompagnement de ses agents en situation de handicap, dès le recrutement et tout au long de la carrière. Afin de préserver le bien-être au travail, l’Inserm mène une politique active en matière de conditions de travail, reposant notamment sur un juste équilibre entre vie personnelle et vie professionnelle.
L'Inserm a reçu en 2016 le label européen HR Excellence in Research et s'est engagé à faire évoluer ses pratiques de recrutement et d'évaluation des chercheurs.
À propos de l'offre
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Vacant à partir du 16/06/2026
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Experte / Expert en calcul scientifique
