Ingénieur de recherche en traitement bioinformatique et analyse statistique de données omiques (H/F)
Référence : FR3743-MARAGU-004
- Fonction publique : Fonction publique de l'État
- Employeur : Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
- Localisation : 31062 TOULOUSE (France)
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- Nature de l’emploi Emploi ouvert uniquement aux contractuels
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Nature du contrat
CDD d'1 an
- Expérience souhaitée Non renseigné
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Rémunération Fourchette indicative pour les contractuels Entre 3143.64 € et 3403.43 € brut mensuel selon l'expérience € brut/an Fourchette indicative pour les fonctionnaires Non renseignée
- Catégorie Catégorie A (cadre)
- Management Non renseigné
- Télétravail possible Non renseigné
Vos missions en quelques mots
Missions :
Assurer le recueil, le traitement et l"analyse des données omiques sur les projets associant la plateforme bioinformatique du CBI. L'agent sera en contact direct avec les biologistes porteurs de projet et sera chargé des données de séquençage. Il/Elle travaillera sur plusieurs projets simultanément dans des domaines variés tels que : transcriptomique, génomique, épigénomique, protéomique, assemblage De Novo …
Activités :
• Assurer le recueil, le contrôle des données et organiser leur stockage
• Réaliser le traitement des données brutes en utilisant ou développant des chaînes de traitement des données, de la collecte à l’analyse statistique
• Choisir et appliquer les méthodes statistiques existantes les plus pertinentes sur les données et les plus performants pour le projet
• Diffuser et valoriser des résultats sous forme de rapports techniques, Participer à l’interprétation des résultats et à la rédaction des synthèses de présentation des analyses statistiques.
• Gérer et maintenir des outils informatiques partagés, notamment participer à l'administration du serveur de calcul
• Conseiller et former aux outils utilisés et effectuer des présentations pour assurer un transfert de compétences
• Assurer une veille scientifique et technologique dans le domaine d'activité
• Assurer un contrôle qualité sur les résultats produits
• Participer à des réseaux professionnels, collaboratifs (en interne et en externe)
Contexte de travail :
Les équipes du Centre de Biologie Integrative (CBI) de Toulouse développent des approches multidisciplinaires, multi-échelles des molécules isolées aux organismes entiers et aux sociétés animales dans le but de comprendre le fonctionnement des organismes vivants. L’utilisation de technologies de séquençage est nécessaire à la poursuite de nombreux projets. La plateforme bioinformatique du CBI est dédiée à l’analyse de ces données permet à tous d’utiliser ces approches devenues incontournables dans de nombreux champs d’investigation de l’ensemble des équipes du CBI.
Sous la responsabilité hiérarchique du responsable technique de la plateforme, l'Ingénieur-e rejoindra une équipe de 3 à 4 personnes pour développer les méthodes d'exploitation et d'analyse des données générées par les équipes de recherche du CBI et les utilisateurs extérieurs de la plateforme. Chacune de ces missions sera réalisée en liaison étroite avec les biologistes des équipes de recherche.
Profil recherché
Competences :
Savoirs / connaissances :
• Techniques informatiques de recueil, analyse et traitement des données omiques, en particulier transcriptomiques, génomiques et épigénomiques
• Expérience ou connaissances générales en biologie, notamment biologie des génomes
• Langages de programmation (R et/ou Python, bash)
• Langue anglaise : écrit et oral
Savoir-faire :
• Traiter des données transcriptomique ou épigénomique
• Programmer dans différents environnements informatiques, notamment sur un serveur ou sur un cluster de calcul, maîtriser l'environnement Linux
• Garantir la qualité et la pertinence des outils d’analyse et des résultats, ainsi que la reproductibilité
• Rédiger la documentation pour les utilisateurs et Réaliser des synthèses
Savoirs-être :
• Transmettre des connaissances et utiliser les techniques de présentation
• Capacité à interagir de façon étroite avec les biologistes
• Assurer une veille
• Travailler en équipe
Contraintes et risques :
• Travail sur écran
• Interaction avec différentes équipes, différents services, différents public (biologistes, informaticiens)
Niveau d'études minimum requis
- Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents
- Spécialisation Sciences naturelles (biologie-géologie)
Langues
- Français Seuil
Qui sommes-nous ?
Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation.
C’est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 33 000 femmes et hommes (dont plus de 16 000 chercheurs et plus de 16 000 ingénieurs et techniciens), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines.
Depuis plus de 80 ans, le CNRS développe des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait du CNRS un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde.
Le partenariat qui lie le CNRS avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
À propos de l'offre
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Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
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Vacant
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Experte / Expert en expérimentation, instrumentation et techniques biologiques
