Ingénieur-e en modélisation de la relation traits-environnement - Cas des peuplements de poissons de l

Votre travail participe des recherches visant à caractériser, comprendre et prédire l’impact des changements globaux sur les peuplements halieutiques des estuaires. 

En effet, les écosystèmes estuariens figurent parmi les plus exposés aux changements globaux. L’estuaire de la Gironde en constitue un cas d’étude emblématique : au cours des quatre dernières décennies, ses conditions environnementales ont profondément évolué, entraînant des modifications majeures de la biodiversité halieutique et du fonctionnement trophique. Pourtant, les liens mécanistiques entre changements environnementaux, structure de la biodiversité et fonctionnement de l’écosystème restent peu explicités.

Vous mobiliserez l’écologie fonctionnelle pour combler ce manque. Votre travail fera directement suite à un stage de M2 durant lequel, à partir de près de 40 ans de suivis halieutiques réalisés par INRAE, nous avons décrit la structure de la communauté de poissons selon deux grandes familles de traits : (i) traits d’histoire de vie (longueur, âge à maturité) et, (ii) guildes écologiques (origine, position dans la colonne d’eau, régime alimentaire). Les valeurs de traits ont été intégrées à l’échelle communautaire via les moyennes pondérées par l’abondance (community-weighted means, CWM), afin d’identifier les traits de réponse aux variations environnementales. Les relations traits–environnement ont été analysées par des approches de modélisation statistique (GAM). Nos résultats révèlent une réorganisation fonctionnelle marquée et non linéaire de la communauté. Une phase de forte marinisation s’est traduite par la dominance d’espèces pélagiques de petite taille, zooplanctonophages et à cycle de vie court. Cette phase a été suivie d’un épisode de réchauffement intense, associé à une sélection d’individus de plus grande taille, suggérant une modification des filtres environnementaux et des contraintes énergétiques. Ces transformations interrogent la structure trophique de l’écosystème dans un contexte de production secondaire contrainte. Elles pourraient, à terme, altérer le rôle de nourricerie estuarienne de la Gironde. 

Vous serez plus particulièrement en charge de :

• la finalisation des travaux engagés durant le stage sur la modélisation statistiques des liens entre facteurs de l’environnement et traits fonctionnels des communautés de poissons
• la structuration et du « nettoyage » du script R afférent à l’analyse
• la rédaction d’une première proposition de publication scientifique des travaux effectués